在国家队冲击世界杯命悬一线的时候，高洪波临危受命再度接手国足，带队4-0胜马尔代夫、2-0胜卡塔尔，奇迹般的晋级十二强赛。此番高洪波再度执掌国足，创造了两个纪录，首先，他是在世预赛关键时刻顶住巨大压力，指挥国足战胜对手获得小组出线权的“土帅”第一人；其次，他是唯一一位两次执教中国队参加两届世界杯预赛的“土帅”。
高洪波宣布辞职
2016年9月1日，中国队迎来了世预赛亚洲区12强赛首场比赛，做客首尔世界杯体育场迎战韩国队。这是国足15年后再次亮相世预赛亚洲区的最后阶段，首战即面对老对手韩国，虽然在实力上不如对手，但经历40强赛最后一轮的逆袭晋级后，国足也要争取在太极虎身上给12强赛首秀开个好头。
高洪波宣布辞职
国足最终以2-3惜败于韩国队。上半时，郑智不慎自摆乌龙，中国队以0-1落后。易边再战，韩国队在4分钟内由李青龙和具滋哲连下两城，中国队一度以0-3落后。但顽强的中国队由于海和蒿俊闵在3分钟内连扳两球，但在剩余的时间内，中国队未能再进一球，最终遗憾落败。
